Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms