Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms