Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGTAO43765 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGTAO43765 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGTAO43765 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGTAO43765 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms