Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms