Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTSS1O43312 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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MTSS1O43312 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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MTSS1O43312 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MTSS1O43312 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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