Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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