Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.6 ms