Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRXO43186 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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