Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms