Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AGRNO00468 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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AGRNO00468 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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AGRNO00468 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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