Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E9PBE3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E9PBE3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E9PBE3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E9PBE3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E9PBE3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E9PBE3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms