Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms