Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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USP17L5A8MUK1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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USP17L5A8MUK1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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USP17L5A8MUK1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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USP17L5A8MUK1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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USP17L5A8MUK1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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USP17L5A8MUK1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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USP17L5A8MUK1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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USP17L5A8MUK1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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USP17L5A8MUK1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L5A8MUK1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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