Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPT2A6NK58 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms