Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms