Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQ87 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQ87 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQ87 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQ87 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms