Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms