Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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