Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms