Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN4Q9Y3Q4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN4Q9Y3Q4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN4Q9Y3Q4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN4Q9Y3Q4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN4Q9Y3Q4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN4Q9Y3Q4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN4Q9Y3Q4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN4Q9Y3Q4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HCN4Q9Y3Q4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HCN4Q9Y3Q4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN4Q9Y3Q4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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