Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms