Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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COPS3Q9UNS2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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COPS3Q9UNS2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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COPS3Q9UNS2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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COPS3Q9UNS2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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COPS3Q9UNS2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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COPS3Q9UNS2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS3Q9UNS2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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