Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX12Q9UMY4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms