Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms