Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms