Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPA4Q9UI42 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPA4Q9UI42 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPA4Q9UI42 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CPA4Q9UI42 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CPA4Q9UI42 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms