Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms