Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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