Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms