Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO40Q9UH90 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms