Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK3Q9UBP4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms