Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms