Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms