Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms