Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN6Q9NWW5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms