Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF275Q9NSD4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF275Q9NSD4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF275Q9NSD4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF275Q9NSD4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF275Q9NSD4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF275Q9NSD4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF275Q9NSD4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF275Q9NSD4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF275Q9NSD4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF275Q9NSD4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms