Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms