Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms