Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM8Q9NQV8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms