Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM10Q9NQV6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms