Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms