Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms