Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms