Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAF1Q9H7N4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms