Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP2Q9H2M9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP2Q9H2M9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP2Q9H2M9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP2Q9H2M9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP2Q9H2M9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP2Q9H2M9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP2Q9H2M9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms