Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms