Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms