Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms