Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms