Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms